近日，李凌君教授團隊在核酸領(lǐng)域國際頂尖學(xué)術(shù)期刊Nucleic Acids Research（《核酸研究》）發(fā)表了題為“Locating, Tracing and Sequencing Multiple Expanded Genetic Letters in Complex DNA Context via a Bridge-Base Approach”的學(xué)術(shù)論文，青年教師王紅磊博士和博士生朱吾元為本文的第一作者,，李凌君教授為通訊作者,，河南師范大學(xué)為唯一通訊單位。該研究得到國家自然科學(xué)基金項目、科技部重點研發(fā)計劃、河南省中原科技領(lǐng)軍人才、高?？萍紕?chuàng)新團隊等項目的資助。
人工堿基是一類能夠在源頭上對遺傳信息進(jìn)行編碼的分子,，它能夠?qū)崿F(xiàn)對遺傳信息存儲量的組合式擴增,，使人類模仿生命系統(tǒng)處理復(fù)雜信息有了巨大的可設(shè)計空間，為非自然生命體的從頭構(gòu)筑提供了新機遇,。然而,，對于包含多個人工堿基核酸的精準(zhǔn)測序目前仍然非常困難。該團隊報告了一種基于橋梁堿基（Bridge Base）的方法來應(yīng)對這一挑戰(zhàn),，通過設(shè)計既能與人工NaM堿基配對又能與天然G堿基配對的新結(jié)構(gòu)isoTAT堿基,，并利用NaM堿基的復(fù)制偏好性，他們實現(xiàn)DNA中的多個TPT3-NaM位點的雙重定位,。利用該方法測定了半合成生命體SSO復(fù)制過程中多個TPT3-NaM在質(zhì)粒中的保留率,，揭示了人工堿基突變的可能原因，提供了首個包含多個TPT3-NaM堿基質(zhì)粒的復(fù)制能力的體外測評提供了首個有效途徑,。此外,，他們通過酶促的TPT3-NaM堿基插入AP位點，使用isoTAT介導(dǎo)的PCR對其進(jìn)行精確定位，實現(xiàn)了包含多損傷位點的DNA樣本的測序,。綜上所述,，本研究工作首次為包含位點和數(shù)量不受限制的人工堿基DNA樣品的準(zhǔn)確定位,、追蹤和測序提供了一種通用和方便的方法,。
論文鏈接：https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkad218/7086673