周運,，男,，1978年3月生，九三學社社員,，副教授,，博士，碩士生導師,。

個人簡歷

1997.9-2001.6 信陽師范學院應用電子技術專業(yè),，本科

2002.9-2005.6 西南石油大學計算機應用專業(yè)，碩士

2012.9-2016.6 河南師范大學生物信息學專業(yè),，博士

電子郵箱: [email protected]

研究方向

生物信息學,，主要從事面向生物醫(yī)學數(shù)據(jù)的深度學習預測模型研究。

主持的科研項目

1. 2024.1-2025.12, 基于深度學習框架的藥物-靶標預測和藥物功能重定位模型研究, 河南省科技攻關項目（242102210001） 主持,，在研

2. 2020.1-2023.12,，面向復雜數(shù)據(jù)的粒計算模型與應用研究，國家自然科學基金面上項目（61976082） 第三參與人,，已結項

3. 2021-2022,，新冠病毒復雜傳播網(wǎng)絡模型構建及傳播社區(qū)發(fā)現(xiàn)方法研究，河南省科技攻關項目（212102310381） 主持,，已結項

4. 2018-2019,，時間序列基因表達譜數(shù)據(jù)的網(wǎng)絡系統(tǒng)生物學方法研究，河南省自然科學基金項目（182300410306） 主持,，已結項

5. 2016-2017,，時間序列基因表達譜的聚類方法研究，河南省教育廳高等學校重點科研項目（17A520039） 主持,，已結項

6. 2012-2014,，提煉和篩選肝再生關鍵基因的方法研究，河南省基礎與前沿計劃技術研究項目（122300410355） 主持,，已結項

發(fā)表論文

[1] Wei Wang*, Bin Sun, MengXue Yu, ShiYu Wu, Dong Liu, Hongjun Zhang, Yun Zhou*.GraphPLBR: Protein-Ligand Binding Residue Prediction With Deep Graph Convolution Network[J].IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2023,20(3): 2223 - 2232

[2] Wei Wang*, MengXue Yu, Bin Sun, Juntao Li, Dong Liu, Hongjun Zhang, XianFang Wang, Yun Zhou*.SMGCN: Multiple Similarity and Multiple Kernel Fusion based Graph Convolutional Neural Network for Drug-Target Interactions Prediction[J].IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2023,14(11):1-12

[3] Wei Wang*, Xili Su, Dong Liu, Hongjun Zhang, Xianfang Wang, Yun Zhou*. Predicting DNA-binding protein and coronavirus protein flexibility using protein dihedral angle and sequence feature[J].Proteins-Structure Function and Bioinformatics,2022,11:1-11

[4]Wei Wang*, Yu Zhang, Dong Liu*, HongJun Zhang, XianFang Wang,Yun Zhou*. Prediction of DNA-Binding Protein-Drug-Binding Sites Using Residue Interaction Networks and Sequence  Feature[J].Front. Bioeng. Biotechnol. 2022,10:82239

[5]Wei Wang*, Yu Zhang, Dong Liu, HongJun Zhang, XianFang Wang, Yun Zhou*. PseAraUbi: predicting arabidopsis ubiquitination sites by incorporating the physicochemical and structural features[J].Plant Molecular Biolog, 2022,110(1-2):81-92

[6]Wei Wang*, Shihao Liang, Mengxue Yu, Dong Liu, HongJun Zhang, XianFang Wang, Yun Zhou*.GCHN-DTI: Predicting drug-target interactions by graph convolution on heterogeneous networks[J].Methods, 2022,206:101-107